Como visto anteriormente, fue MORGAN quién describió el vínculo entre dos genes e drosophila, pero fue STURTEVANT, en 1911, quién propuso que la frecuencia de recombinantes entre dos genes podría ser considerada  una medida de distancia entre dos loci: 1% de recombinantes (o sea, q = 0,01) es igual a una unidad de distancia, denominada centiMorgan (cM). En el caso nombrado anteriormente del color de los ojos y el tipo de ala en drosófila, la distancia entre los dos genes sería 5,2 cM. lo que representa la suma de las frecuencias de los dos recombinantes (2,6% cada uno).

El análisis antes descrito puede ser extendido para el caso en que se consideran 3 caracteres y no solamente dos. En este cruzamiento, el macho es triple homocigoto recesivo abc/abc y la hembra es triple heterocigoto resultante de un apareamiento entre triple homocigoto dominante ABC/ABC y triple recesivo abc/abc. Supongamos que la pareja en cuestión haya producido 1000 descendientes en ocho clases fenotípicas como muestra el cuadro 5.

Se debe considerar solamente dos genes de cada vez. Hubo 367 recombinantes entre los genes A e B, en una progenie de l000. La frecuencia de recombinantes es entonces calculada como siendo 36,7% y la distancia entre A y B es considerada igual a 36,7 cM; entre B y C es calculada en 10,7% y la distancia entre dos genes es considerada igual a 10,7 cM. Aplicando el mismo razonamiento con relación a los genes A y C la distancia entre ellos es estimada en 45,0 cM (esta es una estimativa equivocada, pero eso se verá más adelante).

A partir de estos datos, podemos construir el llamado mapa genético. Sabemos que A y B están separados por 36,7 cM, pero no sabemos si B está a la derecha o a la izquierda de A; por el momento, vamos a suponer que B está a la derecha de A. También sabemos que C está 10,7 cM distante de B. En este caso, podemos estar seguros de que C está a la derecha de B una vez que la distancia de A y C fue calculada en 45 unidades. El mapa genético para estos tres loci puede ser así representado: